Grøn høgeskæg er en slank, opretstående urt med en vækstform, der bærer tynde, forgrenede stængler. Bladene er frisk grønne og sidder spredt langs stænglen, mens de øvre blade har en glat rand uden indrulning. Planten når en højde på mellem 25 og 60 centimeter og fremstår luftig med en let, åben struktur.
Blomsterne er gule og sidder samlet i små, kurveformede stande, der hver måler omkring 1,5 centimeter i diameter. Hver kurv er omgivet af kurvsvøbblade, hvor de ydre ofte er dækket af sorte kirtelhår, mens de indre er glatte. Blomsterne fremstår i en let, luftig samling på de tynde stilke, der også kan have sorte kirtelhår i den øvre del.